For å etterfakturere merverdiavgift opprettes en ny ordre/faktura med to ordrelinjer. I den ene ordrelinjen skriver man inn fakturabeløpet med mva. I den andre ordrelinjen skriver man inn fakturabeløpet som et negativt beløp uten mva. Da vil sluttbeløpet kun bli mva-beløpet.
NB. Når man endrer mva-status til "Registrert i Merverdiavgiftsregisteret, mister man mulighet til å sette mva-sats med 0%. For å få tilgang til mva-kode 6 (som er mva-satsen som brukes før man er mva-registrert), må det være huket av for at man har "omsetning utenfor mva-loven" i mva-innstillingene.